Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsjQ9R014 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms