Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChmlQ9QZD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms