Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn8Q9QZ49 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn8Q9QZ49 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms