Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYJ3

Dnajb1, DnaJ homolog subfamily B member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb1Q9QYJ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajb1Q9QYJ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnajb1Q9QYJ3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms