Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn4Q9QXZ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms