Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca3a1Q9QX15 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms