Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PolkQ9QUG2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms