Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms