Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd2apQ9JLQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms