Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp1Q9JLK7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp1Q9JLK7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms