Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gde1Q9JL56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gde1Q9JL56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms