Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bace2Q9JL18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace2Q9JL18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms