Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc5a3Q9JKZ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc5a3Q9JKZ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms