Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hip1rQ9JKY5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hip1rQ9JKY5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms