Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms