Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms