Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp39a1Q9JKJ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms