Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms