Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uchl3Q9JKB1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uchl3Q9JKB1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms