Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip1Q9JJ57 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms