Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms