Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arfgap1Q9EPJ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfgap1Q9EPJ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms