Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gpr88Q9EPB7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms