Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl4Q9DCU6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms