Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms