Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrpraQ9DBG7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms