Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DA42 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DA42 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DA42 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DA42 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9DA42 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DA42 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DA42 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms