Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms