Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D9H8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms