Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlirpQ9D8T7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms