Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms