Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4bQ9D8B3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4bQ9D8B3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms