Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc9bQ9D6E4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms