Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930556J24RikQ9D4U7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms