Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms