Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc8Q9D2H8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms