Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syf2Q9D198 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms