Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyc1Q9D0M3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyc1Q9D0M3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms