Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnajc18Q9CZJ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnajc18Q9CZJ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms