Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp11Q9CZJ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms