Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms