Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms