Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms