Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd12Q9CWU0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms