Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms