Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sycp2Q9CUU3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sycp2Q9CUU3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sycp2Q9CUU3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms