Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a2Q9CTG6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms