Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rprd1bQ9CSU0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms