Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snw1Q9CSN1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snw1Q9CSN1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms