Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsenenQ9CQR7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms